O Licenciamento Ambiental instituido pela Política Nacional de Meio Ambiente (Lei Federal 6.938 de 1981) é o processo por meio do qual ficam previamente autorizadas a construção, a instalação, a ampliação e o funcionamento de empreendimentos e atividades utilizadores de recursos ambientais, efetiva ou potencialmente poluidores ou capazes, sob qualquer forma, de causar degradação ambiental. A aquabio através de sua equipe técnica especialista em licenciamento realiza os principais licenciamentos ambientais: Licença prévia (LP); Licença de instalação (LI); Licença de operação (LP); Estudos de Impacto Ambiental e Relatório de Impacto Ambiental EIA/RIMA; Plano de Controle Ambiental; Relatório Ambiental Preliminar; Relatório Ambiental Simplificado; Estudo Ambiental; Relatório de controle ambiental; Plano básico Ambiental; Programas ambientais; Monitoramento ambiental; Levantamento e inventário faunístico e florístico; Coleta de germoplasmas; Estudo de viabilidade ambiental; Progrma de educação ambiental; Progama de comunicação social; Plano de controle de poluição ambiental; e demais licenças necessárias para o funcionamento de um empreendimento seja ele hidrelétrico, agropecuário, industrial.